环境工程（工学学位）
四川农业大学环境工程专业开始招生于2001年，2012年入选四川省卓越工程师计划培养计划，2020年入选四川省一流本科专业，2021年入选国家一流本科专业建设点。
该专业培养具有环境工程新理论、新工艺和新设备的研发和应用能力的复合型高级人才，可胜任与环保相关的规划、设计、施工、管理、研发等工作。
主要课程：环境工程微生物学、工程力学、电力电子技术、环境工程原理、环境化学、计算机辅助设计、环境监测、土壤监测技术、环境影响评价、水污染控制工程、大气污染控制工程、固体废物处理与资源化工程、物理性污染控制、生态与环境规划、环境工程设计、境监理、环保工程设备、环境工程设计案例分析等。
就业去向：毕业后能在政府部门、企业及事业单位从事工程设计、环境监测、环境评价、环境规划与管理、环境监理、工程运营管理等工作。
环境科学（理学学位）
本专业依托四川省农村环境保护工程技术中心、四川省土壤环境保护重点实验室以及面向全专业学生的创新创业开放平台，拥有色-质联用、等离子体发射光谱、原子吸收光谱等大型精密仪器设备100余台，专业师资力量雄厚，具有博士学位的教师占80%以上。注重培养学生创新及科研能力、解决实际问题的能力，重点加强学生环境监测及影响评价、生态与环境规划、生态修复等方面的技能培训，重视实践能力锻炼，培养具备生态环境保护、环境监测与质量评价、区域环境管理与规划、环境污染修复等方面的基本理论、基本知识和基本技能的高素质复合型专门人才。
主干学科：环境自然科学、环境技术科学、环境人文社会科学
主要课程：环境学导论、生态学基础、环境化学、环境毒理学、环境工程微生物学、环境地学基础、环境统计分析、环境监测、环境影响评价、生态与环境规划、环境管理学、环境经济学、环境法学、土壤监测技术、土壤污染修复技术等。
就业去向：毕业后能在政府机关、环保部门、农业部门、建设部门、监测单位、工矿企业、科研单位、学校等从事环境管理、环境规划、生态环境修复、环境评价、环境监测、环境监察、安全农产品生产、资源审计、生态环境价值评估、清洁生产审核等方面的工作。
生态学（理学学位）
培养经过污染生态学、城市生态学、生态工程学、生态与环境规划等方面训练，掌握生态学规划、设计、评价和保护等方面的知识与技能，具有社会责任感、自主学习能力、创新创业精神与实践能力的高素质复合型人才。
主要课程：生态学、污染生态学、生态工程学、生态与环境规划、水土保持工程设计、遥感与地理信息系统、生态风险评价、土壤学、城市生态学、植物生理学、生物统计学等。
就业去向：毕业后能在生态环境保护相关企业、政府管理部门、科研机构、高等学校等就业。
环境生态工程（工学学位）
以生态与环境规划、环境工程原理等为主干课，以造价、监理工程师执业资格训练为特色，依托100%博士学位师资及2个省重点实验室（中心）、40余个校企“产-学-研”实验实践平台，培养生态与环境规划、环保工程与设备设计、工程项目预算、管理、监理以及环保技术研发的应用与研究并重的复合型双创人才。
主要课程：生态与环境规划、环境工程原理、环境生态工程、环境信息系统（3S技术）、流域生态工程设计、水土保持工程设计、工程管理与监理经济、生态监测与风险评价、土壤污染与修复技术、土建工程制图、建设工程概预算、测量学、环境监测、生态学、环境微生物学、环境化学等。
就业去向：在政府部门、科研机构、企事业等单位从事生态环境的规划和管理、工程的设计、预算和监理及其他生态环保相关工作。